Título
Perfil proteómico de sueros de pacientes Mexicanos con Diabetes tipo 2 en relación con su índice de masa corporal
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Autor
Gómez Cardona, Erik Elvin
Director
Barba de la Rosa, Ana PaulinaResumen
"La diabetes tipo 2 (DT2) es una crisis global de salud pública que amenaza la
economía de todas las naciones, en particular los países en desarrollo. La
diabetes es un problema de salud importante porque incrementa el riesgo de
enfermedades cardiacas y complicaciones microvasculares como ceguera, falla
renal u neuropatía periférica. La DT2 es el producto de la interacción entre
factores genéticos y ambientales. Algunos individuos son más propensos a
desarrollar esta enfermedad que otros debido a diferencias en su fondo genético,
por ejemplo las personas con ascendencia indigeno-mesoamericana tienen el
doble de probabilidades que los individuos Europeos. La proteómica es una
poderosa herramienta que permitirá descubrir biomarcadores relacionados a
diabetes que a su vez tengan conexión con variables como obesidad, etnicidad,
edad y género. Por esto, el objetivo del presente estudio fue analizar el perfil
proteómico de suero de pacientes Mexicanos con diabetes en relación con su
índice de masa corporal. Los pacientes se agruparon de acuerdo a su índice de
masa corporal en las categorías: Normopeso, Sobrepeso, Obesidad I, Obesidad
II/III y un grupo control de voluntarios sanos. Se colectaron muestras de sangre de
todos los grupos y las proteínas abundantes de suero fueron removidas utilizando
columnas de afinidad MARS14. Las proteínas abundantes y no abundantes fueron
recolectadas para su marcaje con CyDye. Las proteínas fueron separadas en
geles de 24 cm, los cuales fueron escaneados y analizados con el programa
DeCyder 2D (v7.2). Las proteínas diferencialmente acumuladas fueron cortadas
del gel preparativo, digeridas para su análisis por LC-MS/MS e identificadas
utilizando la herramienta de búsqueda MASCOT (v2.5). Se definieron clusters con
diferente comportamiento a través de los grupos de estudio y su tendencia fue
relacionada a una variante del estudio (proteínas relacionadas a diabetes,
obesidad o a ambas) Este estudio presenta evidencia de nuevas proteínas
relacionadas a diabetes en suero que no habían sido previamente reportadas por
el Proyecto de Proteoma de Diabetes Humano (HDPP), estas proteínas podrían
estar relacionadas con las diferencias por etnicidad entre población Europea y
Mexicana y representan candidatos a biomarcadores de la enfermedad." "Type 2 diabetes (T2D) is a global public health crisis that threatens the economies
of all nations, particularly developing countries. Diabetes is a major healthcare
problem because it increases the risk of heart disease, stroke, and microvascular
complications such as blindness, renal failure, and peripheral neuropathy. T2D is
the product of the interplay between genetic and environmental factors. Some
individuals may be more prone to develop type-2 diabetes, because differences in
the genetic backgrounds, for example individuals of mesoamerican-indigenous
ancestry have twice risk than those with European ancestry. Proteomics is a
powerful tool that will help to find biomarkers related to diabetes that might have a
connection with variables such as obesity, ethnic, age and gender. For this, the
aim of the present study was to analyze the serum proteomic profile of Mexican
patients with T2D grouped on their body mass index. Groups were defined
according to the Body Mass Index of each patient into five categories: Normal
weight, Overweight, Obese class I, Obese class II/III and one control group formed
for healthy persons. Blood samples from all groups were collected under informed
consent. Abundant serum proteins were depleted using MARS14 affinity columns.
Abundant and non-abundant proteins were collected for labeling with Cyfluorescent
dyes for DIGE. Proteins were separated on 24 cm gels and scanned
and analyzed with DeCyder 2D differential analysis software (v7.2). Differentially
accumulated protein spots were cut from preparative gels, digested for LC-MS/MS
analysis and identified using MASCOT (v2.5) search engine tool. Groups with
different behavior through the groups were defined and its tendency was related to
a variant on the study (Diabetes, Obesity or Diabetes-Obesity related protein). This
work presents evidence of new diabetic related proteins in serum that has not been
previously reported by the Human Diabetes Proteome Project (HDPP), those
proteins might be related to the ethnicity differences between European an
Mexican population and represent possible candidate biomarkers for the disease."
Fecha de publicación
2015Tipo de publicación
masterThesisÁrea de conocimiento
BIOLOGÍA MOLECULARColecciones
Palabras clave
DiabetesObesidad
Biomarcador
DIGE
Suero
MAGPIX
Electroforesis 2D