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<title>Publicaciones Científicas Biología Molecular</title>
<link>http://hdl.handle.net/11627/6</link>
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<dc:date>2026-04-06T00:56:19Z</dc:date>
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<title>Evaluación biológica de extractos orgánicos y nanopartículas de plata sintetizadas mediante ruta verde a partir de Tecoma stans (L.) Juss. ex Kunth</title>
<link>http://hdl.handle.net/11627/6757</link>
<description>Evaluación biológica de extractos orgánicos y nanopartículas de plata sintetizadas mediante ruta verde a partir de Tecoma stans (L.) Juss. ex Kunth
Gutierrez Garcia, Jose Manuel
"La planta Tecoma stans (L.) Juss. ex Kunth, conocida como “tronadora” o “campanilla amarilla”, se ha utilizado principalmente en la medicina tradicional mexicana para el tratamiento de la diabetes mellitus tipo 2 debido a sus propiedades hipoglucemiantes. Además, se le han atribuido propiedades como cardioprotector, antiulceroso, citotóxico, antiinflamatorio, hepatoprotector, cicatrizante, antiespasmódico, antimicrobiano, antifúngico, analgésico y anticanceroso, razón por la cual esta planta sigue siendo motivo de estudio para conocer sus compuestos activos. Actualmente, el uso de la nanotecnología ha impulsado el uso de nanopartículas (NPs) como estrategia terapéutica dirigida a diversos blancos farmacéuticos. Los estudios de toxicidad indicaron que los extractos orgánicos de Tecoma stans (T. stans) son mayoritariamente seguros, aunque ciertas nanopartículas de plata (AgNPs) mostraron toxicidad elevada dependiendo del disolvente y la concentración. Los ensayos DPPH (2,2-difenil-1-picrilhidracilo) demostraron que los extractos y nanopartículas obtenidos con disolventes polares (metanólico y acetónico) presentan mayor actividad antioxidante, atribuida a la presencia de metabolitos fenólicos. Dado el papel de las especies reactivas de oxígeno (EROs) en enfermedades crónico-degenerativas, estos sistemas representan una alternativa prometedora frente a antioxidantes convencionales. Adicionalmente, las nanopartículas de plata funcionalizadas mostraron una potente actividad antimicrobiana frente a bacterias Gram positivas y Gram negativas, incluyendo patógenos clínicamente relevantes, destacando su potencial como alternativa terapéutica antioxidante y antimicrobiana."; "The plant Tecoma stans (L.) Juss. ex Kunth, known as “tronadora” or “yellow bellflower”, has been used mainly in traditional Mexican medicine for the treatment of type 2 diabetes mellitus due to its hypoglycemic properties. In addition, it has attributed properties such as cardioprotective, anti-ulcer, cytotoxic, antiinflammatory, hepatoprotective, healing, antispasmodic, antimicrobial, antifungal, analgesic, and anticancer, which is why this plant continues to be studied to know its active compounds. Currently, advances in nanotechnology have promoted the use of nanoparticles (NPs) as a therapeutic strategy directed toward diverse pharmaceutical targets. Toxicity studies indicated that the organic extracts of Tecoma stans (T. stans) are largely safe, although certain silver nanoparticles (AgNPs) exhibited high toxicity depending on the solvent and concentration. DPPH (2,2-difenil-1-picrilhidracilo) assays demonstrated that extracts and nanoparticles obtained using polar solvents (methanolic and acetonic) showed higher antioxidant activity, attributed to the presence of phenolic metabolites. Given the role of reactive oxygen species (ROS) in chronic degenerative diseases, these systems represent a promising alternative to conventional antioxidants. Additionally, functionalized silver nanoparticles exhibited strong antimicrobial activity against Gram-positive and Gram-negative bacteria, including clinically relevant pathogens, highlighting their potential as antioxidant and antimicrobial therapeutic alternatives."
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<dc:date>2026-03-20T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Síntesis y Evaluación de Compuestos Quiméricos Derivados de Donepezilo y Vilazodona Dirigidos a Blancos Importantes en el Alzheimer y la Depresión</title>
<link>http://hdl.handle.net/11627/6754</link>
<description>Síntesis y Evaluación de Compuestos Quiméricos Derivados de Donepezilo y Vilazodona Dirigidos a Blancos Importantes en el Alzheimer y la Depresión
Contreras Sánchez, Jazmin
"La enfermedad de Alzheimer (EA) es un trastorno neurodegenerativo progresivo que afecta principalmente a personas mayores. Estudios recientes han demostrado una alta comorbilidad entre la EA y depresión, además una posible interacción entre ambos padecimientos a nivel neuroquímico. La terapia tradicional ha estado enfocada en un solo blanco terapéutico, como la enzima acetilcolinesterasa (AChE) en EA y el receptor 5-HT1A en depresión. Sin embargo, esta estrategia presenta limitaciones en cuanto a eficacia clínica y efectos secundarios. Por ello, se han desarrollado enfoques que combinan múltiples blancos terapéuticos, como la inhibición de AChE y la inhibición de la recaptura de serotonina en la hendidura sináptica, los cuales están implicados en la regulación del estado de ánimo y en procesos cognitivos. Por ello existe la necesidad de desarrollar nuevos agentes terapéuticos multifuncionales que actúen simultáneamente sobre blancos claves involucrados en la EA y en los síntomas depresivos asociados, con el fin de mejorar la eficacia del tratamiento y reducir los efectos adversos. Nuestro objetivo fue desarrollar y evaluar un nuevo prototipo farmacológico quimérico dirigido a la AChE en la EA y 5-HT1A en la depresión. Para llevar a cabo esto, se utilizaron estrategias de síntesis orgánica para la obtención de los compuestos híbridos, tomando como estructuras base de fármacos conocidos como Donepezilo (inhibidor de AChE) y Vilazodona (agonista parcial 5-HT1A). Se realizo la caracterización de los compuestos a través de espectrometría de masas y resonancia magnética nuclear (RMN). La evaluación biológica incluyó ensayos de toxicidad con el modelo de Artemia salina y ensayos in vitro para determinar la inhibición de la AchE. Como resultados se logró la síntesis de dos compuestos híbridos con diferentes perfiles estructurales. El compuesto 1 mostró una baja toxicidad a diferencia del compuesto 2 que fue alta. Además, el compuesto 1 mostró una inhibición mayor de la enzima AChE en comparación con el compuesto 2 que fue menor. La caracterización del compuesto 1 se confirmó tras la correcta asignación de sus señales de protón y carbono presentes en la estructura. En conclusión, ambos compuestos mostraron niveles bajos de inhibición de AChE, sin embargo, el compuesto 1 destacó por presentar una menor toxicidad y una inhibición ligeramente superior, lo que sugiere que podría ser una mejor base estructural para futuras optimizaciones."; "Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder that mainly affects older people. Recent studies have shown a high comorbidity between Alzheimer's disease and depression, as well as a possible interaction between the two conditions at the neurochemical level. Traditional therapy has focused on a single therapeutic target, such as the enzyme acetylcholinesterase (AChE) in AD and the 5-HT1A receptor in depression. However, this strategy has limitations in terms of clinical efficacy and side effects. Therefore, approaches have been developed that combine multiple therapeutic targets, such as AChE inhibition and serotonin reuptake inhibition in the synaptic cleft, which are involved in mood regulation and cognitive processes. Therefore, there is a need to develop new multifunctional therapeutic agents that act simultaneously on key targets involved in Alzheimer's disease and associated depressive symptoms, to improve treatment efficacy and reduce adverse effects. Thus, our objective is to develop and evaluate a new chimerical pharmacological prototype targeting AChE in AD and 5-HT1A in depression. To achieve this, organic synthesis strategies were used to obtain the hybrid compounds, taking as base structures known drugs such as Donepezil (AChE inhibitor) and Vilazodone (5-HT1A partial agonist). The compounds were characterized by mass spectrometry and nuclear magnetic resonance (NMR). Biological evaluation included toxicity assays with the Artemia salina model and in vitro assays to determine AChE inhibition. As a result, the synthesis of two hybrid compounds with different structural profiles was achieved. Compound 1 showed a low toxicity in contrast to compound 2, which was high, and compound 1 showed a higher inhibition of the AChE enzyme compared to compound 2, which was lower. The characterization of compound 1 was confirmed after the correct assignment of the protons and carbons present in the structure, using ¹H and ¹³C NMR spectra. In conclusion, both compounds showed low levels of AChE inhibition, however, compound 1 stood out as having lower toxicity and slightly higher inhibition, suggesting that it could be a better structural basis for future optimizations."
Tesis presentada para obtener el grado de Maestra en Ciencias en el Instituto Potosino de Investigación Científica y Tecnológica, A.C.
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<dc:date>2026-02-26T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Cross-kingdom sRNA Ta_sRNA1 silences PRIM2 to fine-tune Arabidopsis immunity during symbiosis with Trichoderma atroviride</title>
<link>http://hdl.handle.net/11627/6745</link>
<description>Cross-kingdom sRNA Ta_sRNA1 silences PRIM2 to fine-tune Arabidopsis immunity during symbiosis with Trichoderma atroviride
Hernández Hernández, Eyra Judith; Dautt Castro, Mitzuko; Jijón Moreno, Saúl; Padrón Rodríguez, Fernanda; García Ortega, Luis Fernando; González López, María del Carmen; Estrada Rivera, Magnolia; Casas Flores, J. Sergio
·      Trichoderma spp. enhance plant growth and immunity through beneficial root colonization, however, the role of fungal small RNAs (sRNAs) in this interaction remains poorly understood. We identified Ta_sRNA1, a highly abundant T. atroviride sRNA transferred into Arabidopsis root cells, where it loads into ARGONAUTE 1 and 2 (AGO1/2) to modulate host gene expression.&#13;
&#13;
·      Through stem-loop RT-qPCR, AGO immunoprecipitation, transgenic lines and overexpression strains, we validated PRIM2 (encoding the DNA primase large subunit), as a functional Arabidopsis target ofTa_sRNA1. Defense and colonization phenotypes were evaluated in lines altered for Ta_sRNA1 or PRIM2expression, with or without Trichoderma pretreatment.&#13;
&#13;
·      Ta_sRNA1 silencing of PRIM2 restricts Trichoderma overcolonization and enhances resistance to Botrytis cinerea. This repression primes systemic immunity and boosts ROS accumulation without growth penalties. In contrast, PRIM2 overexpression suppresses ROS and promotes necrosis, supporting its role as a susceptibility (S) gene. Sustained Ta_sRNA1 expression compromises Trichoderma-induced systemic resistance and perturbs JA/ET-SA signaling balance.&#13;
&#13;
·      We conclude that Ta_sRNA1 is a cross-kingdom sRNA that promotes immune priming and limits colonization by repressing PRIM2. This positions PRIM2 as a key regulator of ROS and hormone-driven immune balance and highlights fungal sRNAs as fine-tuners of plant defense and mutualism.
All datasets generated and analyzed during this study are publicly available in the institutional repository of IPICYT.
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<dc:date>2026-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Caracterización del dominio carboxilo-terminal  de la GTPasa de bucle GPN Npa3 en Saccharomyces cerevisiae</title>
<link>http://hdl.handle.net/11627/6724</link>
<description>Caracterización del dominio carboxilo-terminal  de la GTPasa de bucle GPN Npa3 en Saccharomyces cerevisiae
Ochoa-Valdez, Manuel de Jesús
"La GTPasa de bucle GPN 1 de levadura (Npa3) participa en el ensamblaje y &#13;
translocación nuclear de la RNA polimerasa II (RNAPII). Npa3 posee un dominio de &#13;
GTPasa (N-terminal) con una extensión en su dominio carboxilo-terminal (C&#13;
terminal) presente únicamente en eucariontes, y ausente en su único ortólogo de &#13;
arqueas. Previamente, se reportó que el C-terminal tiene funciones no relacionadas &#13;
con la RNAPII, debido a que células que expresaban una versión trunca de Npa3 &#13;
carente de los últimos 106 aminoácidos del C-terminal (npa3∆C) mostraron una &#13;
RNAPII con localización nuclear normal, pero una mayor sensibilidad a la &#13;
higromicina B y geneticina. Asimismo, un análisis de matrices genéticas sintéticas &#13;
arrojó que la mutante npa3∆C tenía una fuerte interacción genética negativa con &#13;
genes en diferentes procesos celulares, y particularmente con la mutante bud27∆. &#13;
A pesar de esto, se conoce muy poco sobre cómo funciona o se regula el C-terminal &#13;
de Npa3. En este trabajo, se muestra que los C-terminal de Npa3 y de GPN1 &#13;
humana tienen características estructurales propias de regiones intrínsecamente &#13;
desordenadas con tres motivos de reconocimiento molecular (MoRFs). Ambos C&#13;
terminal no comparten identidad en su secuencia primaria y, a pesar de esto, el C&#13;
terminal de GPN1 pudo reemplazar parcialmente funciones del C-terminal de Npa3 &#13;
en la levadura S. cerevisiae. Adicionalmente, se reportó que Npa3 se fosforila en &#13;
once residuos de su C-terminal, pero se desconoce su importancia fisiológica. &#13;
Células de levadura bud27∆ que expresan una versión no fosforilable de Npa3 &#13;
(npa3-NP) con ocho de los once residuos fosforilables mutados a alanina, mostraron &#13;
una mayor sensibilidad a higromicina B y cicloheximida que las células control. El &#13;
mismo fenotipo se observó mutando únicamente el grupo Ser304/Ser308/Ser313 a &#13;
alanina. En conclusión, en este trabajo se propone que la función del dominio &#13;
GTPasa de Npa3 se regula fuertemente por la fosforilación de su extremo C&#13;
terminal, una región intrínsecamente desordenada."; "Yeast GPN-loop GTPase 1 (Npa3) belongs to a family of GTPases involved in the &#13;
assembly and nuclear targeting of RNA polymerase II (RNAPII). Npa3 features an &#13;
N-terminal GTPase domain (G-domain) and an extended C-terminal domain (CTD), &#13;
which is present exclusively in eukaryotes and absent in the sole GPN protein &#13;
ortholog found in archaea. Previously, we reported that Npa3 possesses additional &#13;
functions unrelated to RNAPII. Yeast cells expressing a truncated version of Npa3 &#13;
lacking the last 106 amino acids (npa3∆C) displayed increased sensitivity to both the &#13;
translation inhibitors hygromycin B and geneticin. Additionally, a synthetic genetic &#13;
array analysis revealed that npa3∆C exhibited strong negative interactions with at &#13;
least 15 genes involved in different cellular processes, most notably with bud27∆. &#13;
However, very little is known about the function or regulatory mechanisms of Npa3 &#13;
CTD. In this work, we show that the CTDs of Npa3 and GPN1 are predicted to be &#13;
intrinsically disordered regions (IDRs) containing three molecular recognition &#13;
features (MoRFs). As expected for an IDR region, yeast Npa3 and human GPN1 &#13;
CTDs do not share conservation at their primary sequence level. Nonetheless, the &#13;
GPN1 CTD can partially substitute for Npa3 CTD function in yeast. Furthermore, &#13;
global proteomic studies have reported that Npa3 is mainly phosphorylated within its &#13;
CTD, although its physiological relevance remains unknown. In yeast bud27∆ cells &#13;
expressing a non-phosphorylatable version of Npa3 (npa3-NP), in which eight &#13;
phosphorylatable residues were mutated to alanine, we observed increased &#13;
sensitivity to hygromycin B and cycloheximide. A similar phenotype was displayed &#13;
in cells expressing an Npa3-NP mutant with only the Ser304/Ser308/Ser313 cluster &#13;
mutated to alanine. In conclusion, we propose that the function of the Npa3 G&#13;
domain is critically regulated through phosphorylation of the S304/S308/S313 cluster &#13;
within its disordered CTD."
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<dc:date>2025-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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