Análisis de la expresión diferencial de genes en hojas de Amaranto(Amaranthus hypochondriacus) bajo estrés salino.

Abstract

"El amaranto es una planta C4 por lo que realiza la fotosíntesis de una manera eficiente en condiciones de alta temperatura y baja disponibilidad de agua. Se cultiva como un cereal alterno debido que se puede obtener una buena producción en suelos infértiles, semiáridos y salinos. Datos actuales demuestran que la salinidad afecta el 20% de los 230 millones de Ha de tierras de riego. La alta concentración de sal en los suelos afecta el crecimiento de las plantas y ocasiona una disminución de la producción agícola. Por medio de la técnica de hibridación supresiva sustractiva (SSH), se obtuvieron genes diferencialmente expresados durante estrés salino en hojas de amaranto, generando con ello genotecas sustractivas. Para esto se emplearon hojas de plantas regaderas con diferentes concentraciones de CaCi2, usando como control regadas con la solución de 20mM CaCl2 y como problema a las regadas con H2O desionizada y 50 mM de CaCl2 condiciones en las que se encuentra menor crecimiento y turgencia de la planta. Los genes diferencialmente obtenidos (sobre expresados y reprimidos en su expresión), fueron secuenciados y sujetos a un análisis bioinformático usando los algoritmos BLASTN, BLASTX y TBLASTX y comparando con la base de datos nr de GenBank, TIGR db Arabidopsis thaliana Genome Projecty, TIGR Rice Genome Annotation y Gene Ontology. De los genes aislados de las genotecas sustractivas, el 34% de función desconocida, 15% no presentaron homología, 12% estaban involucrados en fotosíntesis, 12% relacionados con la respuesta a algún tipo de estrés, 7% intervienen en la regulación de genes, 5% en la traducción de señales, 5% fueron factores de transcripción, 5% en el metabolismo, 3% en el plegamiento de proteínas y 2% en la defensa contra patógenos. La información generada nos permite dilucidar los cambios y mecanismos de respuesta al estrés salino en hojas de amaranto."