Obtención del epigenoma de Trichoderma atroviride en respuesta a la luz azul.

Abstract

"La luz es uno de los factores ambientales más importantes, no sólo porque es utilizada como fuente de energía, sino porque también, es utilizado como fuente de información para regular el desarrollo, comportamiento y rutas metabólicas en la mayoría de los seres vivos. El hongo Trichoderma atroviride, encontrado de manera natural en el suelo, esporula después de un pulso de luz azul. A este proceso se le conoce como fotoconidiación. La mayoría de las respuestas a la luz azul en T. atroviride están reguladas por un complejo fotorreceptor, formado por las proteínas BLR-1 y BLR-2 (blue-light regulator). Este mecanismo de respuesta a la luz influye sobre otras rutas que se encuentras río-abajo, como el metabolismo de carbón y azufre, respuesta al estrés oxidativo, crecimiento vegetativo y reproducción. Las modificaciones epigenéticas –metilación de ADN y modificaciones a las histonas– son conocidas por jugar un papel en el control de la expresión de genes. Las modificaciones en las histonas controlan la accesibilidad a la cromatina y la actividad transcripcional. El mecanismo mejor estudiado es la acetilación de las histonas, el cual ha sido asociado con un estado de transcripción activo. Para investigar la influencia de la acetilación de las histonas sobre las vías de respuesta a la luz, utilizamos ensayos de inmunoprecipitación de la cromatina seguida de una secuenciación (ChIP-seq). Nuestros resultados también identificaron regiones blanco del complejo BLR-1/BLR-2, lo que proveerá de información para poder establecer modelos de redes dependientes de la luz."

"One of the most important environmental factors is light, not only because it is the main source of energy, but also because it regulates development, behavior and metabolic pathways in almost all forms of live. The common soil fungus Trichoderma atroviride sporulates after a brief pulse of blue light. This process is known as photocinidiation. Most blue-light responses in T. atroviride are regulated by a photoreceptor complex formed by the blue-light regulator proteins (BLR-1 and BLR-2). This light-response mechanism impacts diverse downstream pathways such as carbon and sulfur metabolism, response to oxidative stress, vegetative growth, and reproduction. Epigenetic modifications –DNA methylation and histone modifications– are known to play a role in controlling gene expression. Histone modifications control the accessibility of the chromatin and transcriptional activities. The best characterized mechanism is histone acetylation, which has been associated with states of transcriptional activation. To investigate the influence of histone acetylation on light signaling pathways, we used chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq). Our findings also uncovered direct targets of the complex BLR-1/BLR-2, which will provide data to establish patterns of light-dependent networks."