Microsatellite loci and paternity analysis in Nubia and Boer goats

Abstract

"Los loci SRCRSP (Small Ruminant Collaborative Research Support Program) son secuencias de microsatélites polimórficos de 100-300 pares de bases de dinucleótidos repetidos que pueden ser amplificados por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Los alelos de un determinado locus son los productos de PCR de longitud única amplificados con iniciadores específicos. Los loci SRCRSP se han utilizado para identificar individuos, pero no para determinar la paternidad en el ganado caprino. En el presente trabajo se reporta el desarrollo de un método para evaluar la paternidad en caprinos mediante el análisis del polimorfismo de loci SRCRSP en un rebaño de 20 animales, que incluía nueve de raza Nubia y 11 Boer. Se amplificaron 36 alelos: 6 del SRCRSP-1, 5 del SRCRSP-2, 4 del SRCRSP-3, 5 del SRCRSP-4, 5 del SRCRSP-5, 6 del SRCRSP-6 y 5 del SRCRSP-9. Cuatro alelos aparecieron exclusivamente en el grupo Nubia, mientras que sólo ocho en el grupo Boer. El análisis del polimorfismo llegó a 0.995 de certeza en la exclusión correcta del segundo padre. Los loci descritos en este trabajo podrían ser utilizados para controlar la paternidad así como para identificar a los individuos en ganado caprino."

"SRCRSP (Small Ruminant Collaborative Research Support Program) loci are polymorphic 100-300 base pair-long microsatellite sequences of repeated dinucleotides that can be amplified by the polymerase chain reaction (PCR). Alleles of a given locus are the PCR products of unique length amplified with a set of specific primers. SRCRSP loci have been used to identify individuals but not to assess paternity in goats. We have developed a method to assess caprine paternity by polymorphism analysis of SRCRSP loci in a herd of 20 goats from two breeds, nine Nubia and 11 Boer, respectively. Thirty six alleles were amplified: 6 SRCRSP-1; 5 SRCRSP-2; 4 SRCRSP-3; 5 SRCRSP-4; 5 SRCRSP-5; 6 SRCRSP-6 and 5 SRCRSP-9. four alleles appeared only in the Nubia group and eight only in the Boer group. Polymorphism analysis led to a 0.995 certainty for correct exclusion of the second parent. The loci described in this work could be used to control goat paternity as well as to identify individuals."