Construcción y secuenciación de una colección de cromosomas bacterianos artificiales de una levadura cervecera

Abstract

"Las nuevas tecnologías de secuenciación permitieron la obtención de la secuencia genómica de una cepa de levadura cervecera tipo lager; sin embargo, el tamaño corto de las lecturas de estas tecnologías dificulta el proceso de ensamblaje. Una opción para mejorar el borrador de la secuencia es incorporar información de fuentes alternativas como lo son los mapas físicos basados en BACs. Por lo anterior, desarrollamos un protocolo para la construcción de clonas BACs con insertos de DNA de la levadura y obtuvimos las secuencias del extremo del vector (BES) de una colección de ellas. Encontramos que estos BESs pueden contribuir a la mejora del ensamblaje de la secuencia."

"Next-generation sequencing technologies allowed the retrieval of the genome sequence of a lager beer yeast strain; however, the short read size of these technologies hinders the assembly process. One option to improve the draft sequence is by incorporating information from alternative sources such as BACbased physical maps. Therefore, we developed a protocol for the construction of BAC clones with yeast DNA inserts and obtained the BAC-end sequences (BES) of a collection of them. We found that these BESs can contribute to the improvement of the sequence assembly."